Официальный ответ Шоп-Скрипта:

Здравствуйте,

Разработчики и руководство в курсе сложившейся ситуации. В ближайшее время в нашем блоге будет опубликован пост с рекомендациями для клиентов. Проблема наблюдается только в магазинах, на страницах которых установлен код Яндекс.Метрики.
Пользователей, выполнивших наши рекомендации по составлению файла robots.txt данная проблема коснуться не должна:
Рекомендации по составлению файла robots.txt
--
С уважением, Антон
Служба поддержки WebAsyst